博士生导师，现为中国科学院昆明动物所研究员，副所长，中德马普进化基因组学青年科学家小组组长，遗传资源与进化国家重点实验室学术委员会副主任。
1989年毕业于武汉大学生物系, 获学士学位。1992年在已故动物遗传学家施立明院士指导下在中国科学院昆明动物研究所获得硕士学位。1995年10月-1996年6月在美国哥伦比亚大学作访问学者。1996年在施立明和吴鹤龄教授指导下在昆明动物研究所获得博士学位。1997年8月至2002年7月美国芝加哥大学生态与进化学系博士后暨研究助理。

在这个后基因组学时代，理解浩如烟海的基因组学数据不仅是一个热门的话题，更是一件具有挑战性的科学课题。本实验室侧重于了解在自然和人工选择下基因组中新遗传结构及其功能产生的机制和过程。主要包括研究新基因起源和进化的机制，以及以新基因为切入点研究新的通路和网络形成和进化的规律，最终希望以整合遗传、进化和发育的方式，了解遗传、表型形成和生物适应的关系。
在未来几年里，我们将主要围绕自然和人工选择下中新遗传结构及其新功能的起源进化。现阶段主要有以下研究方向：
1、遗传、发育和进化是生命科学中的重要问题。传统的进化发育生物学（Evo-Devo）更多是探讨动物中古老的、共有的发育机制，很多看法和假说难以在物种分化的水平得到验证和阐释。最近Evo-Devo的新发展则主要侧重于种内或近缘种间基因的调控改变。但我们近期关于新基因及其功能起源进化的研究表明，一个崭新基因的出现能对表型或发育过程产生重要的影响。我们计划利用与动物发育和进化相关的新基因，以它们为模型揭示新pathway起源进化和维持调整的机制，探索一条认知遗传、发育和进化统一的新道路。

2、人工选择和基因组进化的机制。家养动物和栽培作物是人类文明和社会赖以存在和发展的重要物质基础。但是，自达尔文首次系统论述家养动物和栽培植物因人工选择而发生显著变异的现象以来，因为囿于人工选育性状的复杂性及其往往不遵循典型的孟德尔遗传方式，人们对于人工选择的遗传机制和在人工选择下基因和基因组的变化、进化规律依然知之甚少，甚至比我们对自然选择机制的了解还少。随着基因组数据的大量积累和进化基因组学研究理论和技术的迅猛发展，现在我们已可以在基因组的大尺度水平系统研究人工选择的遗传作用机制。本研究课题计划通过对驯养生物及其野生种基因组水平和表观基因组学（epigenomics）水平的大规模比较分析，定义受人工选择作用的大量基因和基因组区域，归纳总结人工选择作用的遗传机制和一般规律。利用规模化的转基因技术，鉴别出一批与人工选择性状相关的重要基因，为遗传和基因工程育种提供重要的理论指导和基因及品系资源。
4、其他一些进化基因组学研究课题，如动物毒素基因的起源进化、新性染色体的进化、新外显子的进化等。

类型	项目名称	起止时间	项目主持人
国家重点基础研究发展计划（973计划）项目	人工选择与基因组进化	2007.7-2011.8	王文（首席科学家）
云南省应用基础研究重点项目	水稻基因资源的规模化功能鉴定	2009.1-2011.12	王文
国家自然科学基金委重点项目	年轻新基因在果蝇发育和进化中的作用	20010.1-2014.12	王文
国家自然科学基金委-重点项目	家蚕在人工驯化过程中基因组的表观遗传学变化	2010.9-2015.9	王文

2004获得国家杰出青年基金。2004年“新世纪百千万人才工程国家级首批入选者”。2005年获得国家基金委重点项目资助。2007年作为首席科学家获得了“973”项目的支持。2008年获得“中国科学院王宽诚西部学者突出贡献奖”。在分子进化和基因起源研究方面取得了一些重要结果。近些年的研究一直紧紧围绕新基因的进化和起源这一重大科学问题。目前已经分别在《Science》、《Nature Genetics》、《PNAS》、《Nature》、《Nature Review Genetics》、《Genome Research》、《Plant Cell》、《PLoS Genetics》、《Genetics》、《Mol Bio Evol》、《中国科学》、《科学通报》等一系列重要学术杂志上发表多篇论文。

1.Jiang Y, Li Y, Lee W, Xu X, Zhang Y, Zhao R, Zhang Y*, Wang W*. Venom gland transcriptomes of two elapid snakes (Bungarus multicinctus and Naja atra) and evolution of toxin genes. BMC Genomics, 12 (2011):1-13. (IF 3.8)

2.Zhan Z, Ren J, Zhang Y, Zhao R, Yang S, Wang W*. Evolution of alternative splicing in newly evolved genes of Drosophila. Gene, 470 (2011): 1-6. (IF 2.4)

3.Ding Y, Zhao L, Yang S, Jiang Y, Chen Y, Zhao R, Zhang Y, Zhang G, Dong Y, Yu H, Zhou Q, Wang W*. 2010. A Young Drosophila Duplicate Gene Plays Essential Roles in Spermatogenesis by Regulating Several Y-linked Male Fertility Genes. PLoS Genetics, 6 (12): e1001255. (IF 9.5)

4.Li D, Dong Y, Jiang H, Cai J, Wang W*. 2010 A de novo originated gene depresses budding yeast mating pathway and is repressed by the protein encoded by its antisense strand.  Cell Research 20:408-420. (IF 8.2)

5.Xiang H, Zhu JD, Chen Q, Dai FY, Li X, Li MW, Zhang HY, Zhang GJ, Li D, Dong Y, Zhao L, Lin Y, Cheng DJ, Yu J, Sun JF, Zhou XY, Ma KL, He YH, Zhao YX, Guo SC, Ye MZ, Guo GW, Li YR, Li RQ, Zhang XQ, Ma LJ, Kristiansen K, Guo QH, Jiang JH, Beck S, Xia QY*, Wang W*, Wang J*. 2010. Single base–resolution methylome of the silkworm reveals a sparse epigenomic map. Nature Biotechnology, 28: 516-520. (IF 29.5)

6.Li X, Zhao L, Jiang H, Wang W*   Short homologous sequences are strongly associated with the generation of chimeric RNAs in eukaryotes. J. Mol. Evol. 68 (2009): 56-65.

7.Jiang H, Zhang Y, Sun J, Wang W*, Gu Z*  Differential selection on gene translation efficiency between the filamentous fungus Ashbya gossypii and yeasts. BMC Evolutionary Biology 8 (2008): 3.

8.Zhou Q, Wang W* On the origin and evolution of new genes—a genomic and experimental perspective. J Genet Genomics 35 (2008): 639-648.

9.Zhou Q, Wang J, Huang L, Nie W, Wang J, Liu Y, Zhao X, Yang F, Wang W* Neo-sex chromosomes in the black  muntjac recapitulate incipient evolution of mammalian sex chromosomes.  Genome Biology 9 (2008): R98.

10.Zhou Q, Zhang G, Xu S, Zhao R, Li X, Ding Y, Wang W* On the origin of new genes in Drosophila. Genome Research 18 (2008):1446-1455.

11.Jiang H, Guan W, Pinney D, Wang W*, Gu Z*  Relaxation of yeast mitochondrial functions after whole genome duplication. Genome Research 18 (2008):1466-1471.

12.Cai J, Zhao R, Jiang H, Wang W* De novo origination of a new protein-coding gene in Sacchoramyces cerevisiae. Genetics 179 (2008): 487-496.

13.Yang S, Arguello JR, Li X, Ding Y, Zhou Q, Chen Y, Zhang Y, Zhao R, Brunet F, Peng L, Long M*, Wang W* Repetitive elements-mediated recombination as a mechanism for new gene origination in Drosophila. PLoS Genetics 4(2008):e3.

14.Li X, Liang J, Yu H, Su B, Xiao C, Shang YF*, Wang W* Functional consequences of new exon acquisition in mammalian chromodomain Y-like (CDYL) genes. Trends in Genetics 23 (2007): 427-431.

15.Wang W, Zheng H, Fan C, Li J, Shi J, Cai Z, Zhang G, Liu D, Zhang J, Vang S, Lu Z, Wong GKS, Long M, Wang J  High rate of chimeric gene origination by retroposition in plant genomes.  Plant Cell  18 (2006):1797-1802.

16.Zhou Q, Huang L, Zhang J, Zhao X, Zhang Q, Song F, Chi J, Yang F, Wang W*  Comparative genomic analysis links karyotypic evolution with genomic evolution in the Indian Muntjac (Muntiacus muntjak vaginalis).  Chromosoma 115(2006): 427-436.

17.Jiang H, Liu D, Gu Z, Wang W*  Rapid Evolution in a pair of recent duplicate segments of rice.  J. Exp. Zool.  (Mol. Dev. Evol.) 308B (2006): 50-57.

18.Yu H, Jiang H, Zhou Q, Yang J, Cun Y, Su B, Xiao C, Wang W*  Origination and evolution of a human-specific transmembrane protein gene, c1orf37-dup. Hum. Mol. Genet. 15 (2006):1870-1875.

19.Arguello AJ, Chen Y, Yang S, Wang W*, Long M* Origination of an X-linked Testes Chimeric Gene by Illegitimate Recombination in Drosophila. PLoS Genetics  2 (2006): 745-754.

20.Yu H, Zhao X, Su B, Li D, Xu Y, Luo S, Xiao C, Wang W* Expression of NF1 Pseudogenes. Hum. Mutat 26 (2005): 487-488.

21.Wang W *et al., Origin and Evolution of New Exons in Rodents. Genome Res. 15 (2005): 1258-1264.
   
22.Peng L, Zheng H, Li X, Yang S, Chen H, Wang W*  Origin and evolution of new exons in the rodent zinc finger protein 39 gene.  Chinese Science Bulletin 50 (2005): 1120-1125.

23.Lee WH, Li Y, Lai R, Li S, Zhang Y, Wang W* Variety of Antimicrobial Peptides in the Bombina maxima Toad and Evidence of their Rapid Diversification. Eur. J. Immunol. 35 (2005): 1220-1229.

24.Wang W. as one of the authors of  The genome of Oryza sativa: A history of Duplications.  PLoS Biol. 3 (2005): e38.

25.Wang W. as one of the authors in the Silkworm Genome Sequencing Consortium. A draft sequence for the genome of the domesticated silkworm (Bombyx mori). Science 306 (2004): 1937-1940.

26.Wang W, Yu H, Long M  Duplication-degeneration as a mechanism of gene fission and the origin of new genes in Drosophila.  Nature Genetics 36 (2004)：523-527.

27.Wang W, Thornton K., Emerson JJ,  Long M  Nucleotide variation and recombination along the fourth chromosome in Drosophila simulans. Genetics 166 (2004): 1783-1794.

28.Long M, Betran E, Kevin T, Wang W  Origin of new genes: Glimpses from the young and old.  Nature Review Genetics 4 (2003): 856-875. 

29.Wang W, Brunet FG, Nevo E, Long M Origin of Sphinx, a young chimeric RNA gene in Drosophila melanogaster. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99 (2002): 4448-4453.)

30.Wang W, Thornton K, Berry A, Long M  Nucleotide variation along the Drosophila melanogaster fourth chromosome. Science  295 (2002): 134-137.

31.Wang W, Zhang J, Alvarez C, Llopart A, Long M  2000  The origin of the jingwei gene and the complex modular structure of its parental gene, yellow emperor, in D. melanogaster. Mol Biol. Evol. 17 (2000): 1294-1301.

32.Wang W, Lan H  Rapid and parallel chromosomal number reductions in muntjac deer inferred from mitochondrial DNA phylogeny.  Mol. Biol. Evol. 17 (2000): 1326-1333.

33.Wyckoff G, Wang W, Wu C-I  Rapid evolution of male reproductive genes in the descent of man.  Nature 403 (2000): 304-309.