酵母菌系统学与分子进化课题组
1. 组长简介
白逢彦，博士，研究员，博士生导师，国家杰出青年基金获得者，中国科学院百人计划人才入选者。主要从事酵母菌系统分类、分子进化和群体遗传方面的研究。在酵母菌分子分类新方法建立、酵母菌种属概念和分类系统更新、工业酵母菌群体演化和病原酵母菌分子流行病学研究方面取得了系列重要研究成果。已发表学术论文60余篇，参与国际酵母菌系统学研究领域权威专著和工具书《The Yeasts, a Taxonomic Study》第5版(Elsevier，2011)的编著。现任国际SCI期刊《Mycoscience》编辑、《FEMS Yeast Research》编委及国际酵母菌委员会(International Commission on Yeasts)委员等职。
2. 组长工作经历
2011.01 - 现在 中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室（筹），研究员。
2006.01 - 2010.12 中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学重点实验室，研究员，副主任
1999.11 - 2005.12 中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学重点实验室，研究员。
1996.09 - 1999.10 中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学重点实验室，副研究员
2008.12 - 2009.03. 日本千叶大学医学部医学真菌研究中心，客座教授
2002.01 - 2002.07. 日本畜产草地研究所，JSPS Fellow。
1999.04 - 1999.10. 日本理化学研究所，Researcher。
1997.02 - 1997.08. 日本理化学研究所，Researcher。
3. 组长教育背景
1991.09 - 1996.04 中国科学院研究生院微生物学专业，获博士学位
1984.09 - 1987.09 中国科学院研究生院微生物学专业，获硕士学位
1980.09 - 1984.07 中山大学生物系植物学专业，获学士学位
4. 主要研究内容及目标
酵母菌生物多样性、分子进化和群体遗传。在酵母菌资源调查、分类鉴定和菌种保藏的基础上，重点进行下述方面的研究：1) 酵母菌系统发育、物种分化与形成机制；2) 酿酒酵母群体遗传及生产性能的遗传基础与改造；3) 条件致病酵母菌的群体演化和分子流行病学。
5. 承担主要科研项目
主持的科研项目
国家自然科学基金委员会重大国际合作项目：担子菌酵母的分子系统发育(2011-2013)；
国家杰出青年科学基金项目：酵母菌资源与系统学 (2009-2012)；
国家自然科学基金面上项目：中国病原念珠菌的种群和基因型分布(2008-2010)；
国家自然科学基金海外青年学者合作研究基金：中国病原酵母白色念珠菌的多基因谱系分析(2007-2009)；
国家自然科学基金面上项目：酵母菌种间和种内染色体和rRNA等基因序列的变异性或保守性分析 (2005-2007)；
国家“十五”科技攻关计划项目：女性生殖道感染的相关研究 (2005-2006)；
国家自然科学基金探索项目：致病念珠菌的遗传多样性和基因型分析 (2006.1-2006.12；
国家自然科学基金面上项目：中国掷孢酵母及相关类群的物种多样性和分子系统学研究(2002-2004)；
国家自然科学基金青年基金项目：假丝酵母属的分子分类学研究 (1998 -2000)。
作为主要研究者承担的科研项目
中国科学院知识创新工程重要方向项目：微生物重要类群系统发育重建与分子进化研究(2001-2004)；
国家863计划生物和现代农业技术领域课题：重要微生物资源的研究和保存 (2001-2005)；
国际合作项目“亚洲微生物研究网络ANMR”(1995- 1999)；
“七.五”国家医学重点科技攻关项目：微生物毒素及其它有机物致大骨节病作用的研究(1986-1990)。
6. 主要研究成果简介
建立了酵母菌rDNA序列差异快速检测的PCR-SSCP分析新方法，有效提升了酵母菌生物多样性研究能力和水平，已发表酵母菌新属3个，新种70余个；解决了一系列酵母菌种、属概念和系统关系问题，更新了一些类群的分类系统；建立了病原酵母菌的DNA指纹和基因型分析新技术，发现了念珠菌基因型与致病类型和感染程度的相关性，为解决念珠菌生殖器感染流行病学研究中的存疑问题提供了关键依据。
7. 学术兼职
2011-现在 《Mycoscience》编辑
2011-现在 《中国真菌学杂志》副主编
2008-现在 国际酵母菌委员会(International Commission on Yeasts)委员
2008-现在 中国菌物学会常务理事，副秘书长
2008-现在 《菌物学报》副主编
2008-现在 《中华微生物学和免疫学杂志》编委
2006-现在 《微生物学报》、《菌物研究》、《生物学通报》编委
2004-现在 中国微生物学会真菌专业委员会副主任委员
2001-现在 《FEMS Yeast Research》编委
9. 研究队伍
名单
固定人员：
王启明，博士，副研究员
刘新展，博士，助理研究员
在学研究生：
葛书华 2007-2012
郭新颜 2008-2011
解 晶 2008-2013
刘晚秋 2009-2014
邵颖倩 2010-2015
合影及个人照片
队伍主要骨干简介等
王启明，博士，副研究员
学历：
1994－1998年，于山东农业大学农产品加工与储运专业，获学士学位；
1998－2001年，于华中农业大学微生物学专业，获硕士学位；
2001－2004年，于中国科学院微生物研究所微生物学专业，获博士学位。
研究工作简历：
2001年－2004年在中科院微生物所酵母菌研究组读博士学位。2004年毕业后留在了微生物研究所工作，任助理研究员，2008年底被聘为副研究员。近10年来，一直从事酵母菌的研究。
刘新展，博士，助理研究员。
学历：
1999.9-2003.7：河南农业大学，生物工程学院，植物病理，学士；
2003.9-2006.7：云南农业大学，植物保护学院，植物病理，硕士；
2006.9-2009.7：中国科学院生态环境研究中心，环境科学，博士。
研究简历：
2009年毕业于中国科学院生态环境研究中心并获得环境科学专业博士学位，导师贺纪正研究员。研究生在读期间，从事微生物生态学研究，主要研究方向为土壤微生分子生态学，在土壤细菌、真菌及与土壤功能微生物如硫还原菌的群落组成及多样性等方面做了相关的研究工作。2009 年进入中国科学院微生物研究所酵母菌生物多样性和系统演化课题组工作，主要从事酵母菌生态学研究。已经开展了我国亚热带森林生态系统中叶际酵母菌生物多样性及群落组成等研究工作。目前已发表研究论文6 篇，其中SCI 论文4篇。
10. 已毕业人员
（姓名，博士/硕士，某年-某年，现工作/学习地点等）
赵建花，硕士，1999-2002，现在美国
王启明，博士，2001-2004，现在本室工作，任副研究员
陆惠忠，硕士，2002-2004，现在？
吴作为，博士，2003-2006，现在美国进行博士后研究
王士安，博士，2003-2008，现在中国科学院青岛生物能源与过程研究所从事科研工作。
李 娟，博士，2004-2007，现在中国疾病控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室从事科研工作。
冀朝辉，博士，2005-2008，现任中学教师
王 辰，硕士，2005-2008，现在美国读博士研究生
11. 代表性文章、专著、专利等成果清单
1) Nakase T, Bai FY, Boekhout T. 2011. Bensingtonia Ingold emend. Nakase & Boekhout (1986). In The Yeasts: a Taxonomic Study, pp. 1623–1659. Edited by C. P. Kurtzman, J. W. Fell & T. Boekhout. Amsterdam: Elsevier.
2) Boekhout T, Bai FY, Nakase T. 2011. Bullera Derx (1930). In The Yeasts: a Taxonomic Study, pp. 1623–1659. Edited by C. P. Kurtzman, J. W. Fell & T. Boekhout. Amsterdam: Elsevier.
3) Wang QM, Bai FY*, Fungsin B, Boekhout T, Nakase T. 2011. Proposal of Mingxiaea gen. nov. for the anamorphic basidiomycetous yeast species in the Bulleribasidium clade (Tremellales) based on molecular phylogenetic analysis, with six new combinations and four novel species. Int J Syst Evol Microbiol 61: 210-219.
4) Ge SH, Wan Z, Li J, Xu JP, Li RY, Bai FY*. 2010. Correlation between azole susceptibilities, genotypes, and ERG11 mutations in Candida albicans isolates associated with vulvovaginal candidiasis in China. Antimicrob Agents Chemother 54: 3126-3131.
5) Wang SA, Bai FY*. 2010. Lindnera wuzhiensis sp. nov., a novel ascomycetous yeast species. J Gen Appl Microbiol 56: 409‒412.
6) Zhang Y, Zhang S, Wang M, Bai FY, Liu X*. 2010. High diversity of the fungal community structure in naturally-occurring Ophiocordyceps sinensis. PLoS One 5: e15570.
7) Ji ZH, Jia JH, Bai FY*. 2009. Four novel Candida species in the Candida albicans/Lodderomyces elongisporus clade isolated from the gut of flower beetles. Antonie van Leeuwenhoek 95: 23-32.
8) Wang QM, Xu JP, Wang HM, Li J,Bai FY*.2009.Torulaspora quercuum sp. nov. and Candida pseudohumilis sp. nov., novel yeasts from human and forest habitats. FEMS Yeast Research 9: 1322–1326.
9) Liu XP, Fan SR*, Bai FY, Li J, Liao QP. 2009. Antifungal susceptibility and genotypes of Candida albicans strains from patients with vulvovaginal candidiasis. Mycoses 52: 24–28.
10) Wang SA, Bai FY*. 2008. Saccharomyces arboricolus sp. nov., a new yeast species from tree bark. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 58: 510-514.
11) Fan SR, Bai FY*, Liu ZH, Li J, Liu XP. 2008. Genotype distribution of Candida albicans strains associated with different conditions of vulvovaginal candidiasis, as revealed by microsatellite typing. Sex. Transm. Infect. 84: 103-106.
12) Wang QM*, Jia JH, Bai FY.2008. Diversity of basidiomycetous phylloplane yeasts belonging to the genus Dioszegia (Tremellales) and description of Dioszegia athyrium sp. nov., Dioszegia cream sp. nov and Dioszegia xingshanensis sp. nov. Antonie van Leeuwenhoek 93: 391–399.
13) Ji ZH, Bai FY*. 2008. Ogataea ganodermae sp. nov., a methanol- assimilating yeast species isolated from fruit bodies of Ganoderma. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 58: 1502-1506.
14) Wang QM, Li J, Wang SA, BaiFY*.2008. Rapid Differentiation of Phenotypically Similar Yeast Species by Single-Strand Conformation Polymorphism of Ribosomal DNA. Appl. Environ. Microbiol. 74(9): 2604–2611.
15) Wang SA, Jia JH, Bai FY. 2008. Candida alocasiicola sp. nov., Candida hainanensis sp. nov., Candida heveicola sp. nov. and Candida musiphila sp. nov., novel anamorphic, ascomycetous yeast species isolated from plants. Antonie van Leeuwenhoek 94: 257–265.
16) Wang QM, Bai FY. 2008. Molecular phylogeny of basidiomycetous yeasts in the Cryptococcus luteolus lineage (Tremellales) based on nuclear ribosomal RNA and mitochondrial cytochrome b gene sequence analyses: proposal of Derxomyces gen. nov. and Hannaella gen. nov., and description of eight novel Derxomyces species. FEMS Yeast Research8: 799–814.
17) Li J, Fan SR, Liu XP, Li DM, Nie ZH, Li F, Lin H, Huang WM, Zong LL, Jin JG, Lei H, Bai FY*.2008. Biased genotype distributions of Candida albicans strains associated with vulvovaginal candidosis and candidal balanoposthitis in China. Clin. Infect. Dis. 47:1119–1125.
18) Wang QM, Wang SA, Jia JH, Bai FY*. 2007.Cryptococcus tibetensis sp. nov., a novel basidiomycetous anamorphic yeast species isolated from plant leaves. J. Gen. Appl. Microbil. 53 (5): 281-285.
19) Li J, Bai FY*. 2007. Single-strand conformation polymorphism of microsatellite for rapid strain typing of Candida albicans. Med Mycol 45: 629-635.
20) Wang QM, Jia JH, Bai FY*.2006. Pseudozyma hubeiensis sp. nov. and Pseudozyma shanxiensis sp. nov., novel ustilaginomycetous anamorphic yeast species from plant leaves. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 56: 289-293.
21) Wu ZW, Robert V, Bai FY*. 2006. Genetic diversity of the Pichia membranifaciens strains revealed from rRNA gene sequencing and electrophoretic karyotyping, and the proposal of Candida californica comb. nov. FEMS Yeast Res. 6: 305-311.
22) Wu ZW, Bai FY*. 2006. Candida tibetensis sp. nov. and Candida linzhiensis sp. nov., novel anamorphic, ascomycetous yeast species from Tibet. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 56: 1153-1156.
23) Wang QM, Jia JH, Bai FY*. 2006. Bensingtonia pseudonaganoensis sp. nov., a novel ballistoconidium-forming yeast species isolated from plant leaves. Antonie van Leeuwenhoek 89(2): 261-266.
24) Li J, Xu YC, Bai FY*.2006. Candida pseudorugosa sp. nov., a novel yeast species from the sputum. J. Clin. Microbiol. 44: 4486–4490.
25) Xue ML, Zhang LQ*, Wang QM, Zhang JS, Bai FY. 2006. Metschnikowia sinensis sp. nov., Metschnikowia zizyphicola sp. nov. and Metschnikowia shanxiensis sp. nov., three novel yeast species from jujube fruit. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 56: 2245-2250.
