1. 组长简介
2000年获University of Iowa博士学位,2005年入选中科院“百人计划”(引进国外杰出人才),2009年获“国家杰出青年基金”资助并入选“新世纪百千万人才工程”国家级人选,2010年在“百人计划”终期考核中被评为优秀。
2. 组长工作经历
2005.2 - 现在 真菌学国家重点实验室(筹),研究员,博士生导师
2002.8 - 2005.1 Givaudan Flavors, Research Scientist II
2000.3 - 2002.8 OSI Pharmaceuticals, Inc., Research Scientist, Senior Research Scientist
3. 组长教育背景
1995.8 - 2000.3 University of Iowa, Organic Chemistry, 博士学位
1994.1 - 1995.6 Clarkson University, Organic Chemistry, 硕士学位
1985.9 - 1989.7 南开大学化学系,学士学位
4. 主要研究内容及目标
研究方向:
特境真菌次生代谢产物的药理活性及其生态学意义。
研究内容及目标:
以重要疾病为靶标进行特境真菌次生代谢产物的活性筛选与化学研究,高效发现新结构活性化合物,并进行综合评价、作用机制与构效关系研究,发现自主知识产权的新药先导化合物。同时,以次生代谢产物为探针,探索特境真菌互作与环境适应机制,以及重要活性产物的生物合成途径及调控机制。
5. 承担主要科研项目
(1) 诱导肿瘤细胞凋亡的新结构天然小分子化合物的发现及作用机制
国家自然科学基金 (30870057; 2009.1–2011.12);主持;
(2) 特境真菌新结构候选化合物研究
国家杰出青年科学基金(30925039; 2010.1–2013.12);主持;
(3) 特境微生物新活性物质的发现
《国家重点基础研究发展计划》(973)“中国特有植物和微生物药用活性物质的基础研究”课题 (2009CB522302; 2009.1–2013.12);骨干;
(4) 基于微生物资源与技术的功能产品研发
科学院重要方向项目群 (KSCX2-EW-G-6; 2011.1–2013.12);主持。
6. 主要研究成果简介
新结构活性物质的高效发现
近年来从特殊生存策略(环境)真菌中发现了约600个新结构次生代谢产物(含47个新骨架分子),部分具有显著的药理活性。基于上述部分研究成果发表的一系列新骨架化合物分别被本领域权威综述期刊Nat. Prod. Rep.选为2007年(2007. 24: 1208)、2008年(2008. 25: 443)、2009年(2009. 26: 1229),2010年(2010. 27: 477; 1381),以及2011年(2011. 28: 183; 1346)的“Hot off the press”(热点报道)。其中有关3个新骨架分子的研究在国际重要期刊Chem. Eur. J.以“Cover Picture”形式发表。发表在本领域国际核心期刊J. Nat. Prod.的4篇研究论文(2008. 71: 615; 664; 1861; 2009. 72: 182.)先后被选为该期刊2008–2011年发表文章的“Top 20 Most Cited”。
抗肿瘤化合物的作用机制研究:
从冬虫夏草定殖真菌Gliocladium sp.中发现的强活性抗肿瘤ETP类化合物能激活死亡受体及线粒体介导的肿瘤细胞凋亡,体内试验结果表明它们在低剂量时能显著抑制小鼠体内黑色素瘤(B16)的增殖(Cell Prolif. 2009. 42: 838;与叶昕研究员合作),其中1个分子的LD50 > 500 mg/kg体重,具有良好的选择性。进一步研究表明,该类分子不仅能诱导肿瘤细胞凋亡及坏死,还能导致自噬,其发生需要PARP与RIP1参与,先于caspase-dependent的凋亡发生并可能对凋亡具有一定的贡献(Autopahgy, 2011. 7: 598;与姜学军研究员合作)。目前已对该类化合物的生物合成途径及调控机制开展研究,拟采用基因工程的手段大幅度提高其产量并发现新的同系物(与刘刚研究员合作),为进一步的结构修饰与改造、作用靶点、机制研究,以及药效与毒性评价提供原料。
7. 学术兼职
《Natural Products and Bioprospecting》编委(Springer;2011–)
Mycology Associate Editor(Taylor & Francis; 2010–)
《Mycosystema》、《中国天然药物》编委(2008–)
中国菌物学会常务理事、菌物化学专业委员会主任委员(2008–)
中国科学院真菌地衣系统学重点实验室学术委员(2007–)
中国科学院微生物研究所学术委员、学位评定委员(2006–)
8. 研究队伍
研究组成员:
李二伟,博士,副研究员
刘 玲,博士,副研究员
任晋玮,博士,助理研究员
吴先富,博士,助理研究员
刘述春,学士,研究实习员
蔡晓月,硕士,研究实习员
博士研究生:罗辑,林洁,李剑,张帆,牛树斌,孙孟琪
硕士研究生:冯宇,邓联武,陈申习
客座研究生:文浩(暨南大学),张坤(上海交通大学)

9. 已毕业人员
郭慧娟,硕士(2004.7-2007.8)-德国马普学会化学生态所
刘 玲,博士(2005.7-2009.5)-中国科学院微生物研究所
丁 刚,博士(2005.7-2009.5)-中国医学科学院药用植物研究所
张永刚,博士(2005.7-2009.5)-山东省科学院生物研究所
李 彦,博士(2005.7-2011.3)-军事医学科学院毒物药物研究所
王寅超,硕士(2008.7-2011.3)-北京出入境检验检疫局
马 诚,硕士(2008.7-2011.3)-成都生物制品研究所
邹先伟,博士(2005.7-2011.5)-待定
10. 代表性文章、专著、专利等成果清单
通讯作者研究论文
1. Li, J.; Li, L.; Si, Y.; Jiang, X.; Guo, L.; Che, Y.* 2011, Virgatolides A–C, benzannulated spiroketals from the plant endophytic fungus Pestalotiopsis virgatula. Org. Lett. 13 (10): 2670–2673. (Nat. Prod. Rep. “Hot off the press”; 2011: 28: 1346)
2. Zhang, N.; Chen, Y.; Jiang, R.; Li, E.; Chen, X.; Xi, Z.; Guo, Y.; Liu, X.; Zhou, Y.; Che, Y.*; Jiang, X.* 2011. PARP and RIP1 are required for autophagy induced by 11'-deoxyverticillin A, which precedes caspase-dependent apoptosis. Autophagy 7(6): 598–612.
3. Liu, L.#; Bruhn, T.#; Guo, L.; Götz, D. C. G.; Brun, B.; Stich, A.; Che, Y.*; Bringmann, G.* 2011. Chloropupukeanolides C–E, cytotoxic pupukeanane chlorides with a spiroketal skeleton from Pestalotiopsis fici. Chem. Eur. J. 17(9): 2604–2613. (Cover Picture)
4. Ma, C.; Li, Y.; Niu, S.; Zhang, H.; Liu, X.; Che, Y.* 2011. N-Hydroxypyridones, phenylhydrazones, and a quinazolinone from Isaria farinosa. J. Nat. Prod. 74(1): 32–37.
5. Wang, Y.; Niu, S.; Liu, S.; Guo, L.; Che, Y.*2010. The first naturally occurring thiepinols and thienol from an endolichenic fungus Coniochaeta sp. Org. Lett. 12(21): 5081–5083.(Nat. Prod. Rep. “Hot off the press”; 2011. 28: 183)
6. Li, Y.; Niu, S.; Sun, B.; Liu, S.; Liu, X.; Che, Y.* 2010. Cytosporolides A–C, antimocrobial meroterpenoids with a unique peroxylactone skeleton from Cytospora sp. Org. Lett. 12(14): 3144–3147. (Nat. Prod. Rep. “Hot off the press”; 2010. 27: 1381)
7. Liu, L.; Gao, H.; Chen, X.; Cai, X.; Yang, L.; Guo, L.; Yao, X.;Che, Y.* 2010. Brasilamides A–D, sesquiterpenoids from the plant endophytic fungus Paraconiothyrium brasiliense. Eur. J. Org. Chem. 3302–3306.
8. Wang, Y.; Zheng, Z.; Liu, S.; Zhang, H.; Li, E.; Guo, L.; Che, Y.* 2010. Oxepinochromenones, furochromenone, and their putative precursors from the endolichenic fungus Coniochaeta sp. J. Nat. Prod. 73(5): 920–924.
9. Liu, L.; Niu, S.; Lu, X.; Chen, X.; Zhang, H.; Guo, L.; Che, Y.* 2010. Unique metabolites of Pestalotiopsis fici suggest a biosynthetic hypothesis involving a Diels-Alder reaction and then mechanistic diversification. Chem. Commun. 46(3): 460–462. (Nat. Prod. Rep. “Hot off the press”; 2010. 27: 477)
10. Li, J.; Liu, S.; Niu, S.; Zhuang, W.; Che, Y.* 2009. Pyrrolidinones from the ascomycete fungus Albonectria rigidiuscula. J. Nat. Prod. 72(12): 2184–2187.
11. Guo, H.; Sun.; B, Gao, H.; Chen, X.; Liu, S.; Yao, X.; Liu, X.; Che, Y.* 2009. Diketopiperazines from the Cordyceps-colonizing fungus Epicoccum nigrum. J. Nat. Prod. 72(12): 2115–2119. (Epicoccin G被K. C. Nicolaou组全合成; J. Am. Chem. Soc. 2011. 133: 8150)
12. Guo, H.; Sun, B.; Gao, H.; Niu, S.; Liu, X.; Yao, X.; Che, Y.* 2009. Trichocladinols A–C, cytotoxic metabolites from a Cordyceps-colonizing ascomycete Trichocladium opacum. Eur. J. Org. Chem. 32: 5525–5530.
13. Liu, L.; Li, Y.; Liu, S.; Zheng, Z.; Chen, X.; Zhang, H.; Guo, L.; Che, Y.* 2009. Chloropestolide A, an antitumor metabolite with an unprecedented spiroketal skeleton from Pestalotiopsis fici. Org. Lett. 11(13): 2836–2839. (Nat. Prod. Rep. “Hot off the press”; 2009. 26: 1229)
14. Chen, Y.; Guo, H.; Du, Z.; Liu, X.; Che, Y. ;* Ye, X.* 2009. Ecology-based screen identifies new metabolites from a Cordyceps-colonizng fungus as cancer cell proliferation inhibitors and apoptosis inducers. Cell Prolif. 42(6): 838–847.
15. Li, Y.; Ye, D.; Chen, X.; Lu, X.; Shao, Z.; Zhang, H.; Che, Y.* 2009. Breviane spiroditerpenoids from an extreme-tolerant Penicillium sp. isolated from a deep sea sediment sample. J. Nat. Prod. 72(5): 912–916.
16. Ding, G.; Li, Y.; Fu, S.; Liu, S.; Wei, J.; Che, Y.* 2009. Ambuic acid and torreyanic acid derivatives from the endolichenic fungus Pestalotiopsis sp. J. Nat. Prod. 72(1): 182–186. (One of the “Top 20 Most Cited” articles for the journal that were published from 2008–2011.03.31).
17. Liu, L.; Liu, S.; Chen, X.; Guo, L.; Che, Y.* 2009. Pestalofones A–E, bioactive cyclohexanone derivatives from the plant endophytic fungus Pestalotiopsis fici. Bioorg. Med. Chem. 17(2): 606–613.
18. Liu, L.; Liu, S.; Jiang, L.; Chen, X.; Guo, L.; Che, Y.* 2008. Chloropupukeananin, the first chlorinated pupukeanane derivative and its precursors from Pestalotiopsis fici. Org. Lett. 10(7): 1397–1400. (Nat. Prod. Rep.“Hot off the press”; 2008. 25: 443)(核心骨架被Susumu Kobayashi组合成;Org. Lett. 2010. 12: 2920.)
19. Li, E.; Jiang, L.; Guo, L.; Zhang, H.; Che, Y.* 2008. Pestalachlorides A–C, antifungal metabolites from the plant endophytic fungus Pestalotiopsis adusta. Bioorg. Med. Chem. 16(17): 7894–7899. (Pestalachloride A被Hans-Gűnther Schmalz组全合成;Angew. Chem. Int. Ed. 2010. 49:1)
20. Ding, G.; Jiang, L.; Guo, L.; Chen, X.; Zhang, H.; Che, Y.* 2008. Pestalazines and pestalamides, bioactive metabolites from the plant pathogenic fungus Pestalotiopsis theae. J. Nat. Prod. 71(11): 1861–1865. (One of the “Top 20 Most Cited” articles for the journal that were published from 2008–2011.04.31).
21. Zhang, Y.; Tian, R.; Liu, S.; Chen, X.; Liu, X.; Che, Y.* 2008. Alachalasins A–G, new cytochalasins from the fungus Stachybotrys charatum. Bioorg. Med. Chem.16(5): 2627–2634.
22. Li, E.; Tian, R.; Liu, S.; Chen, X.; Guo, L.; Che, Y.* 2008. Pestalotheols A–D, bioactive metabolites from the plant endophytic fungus Pestalotiopsis theae. J. Nat. Prod. 71(4): 664–668. (One of the “Top 20 Most Cited” articles for the journal that were published from 2008–2011.03.31) (Pestalotheol D被Christopher J. Moody组全合成;Chem. Eur. J. 2011. 17:1972.)
23. Liu, L.; Tian, R.; Liu, S.; Chen, X.; Guo, L.; Che, Y.* 2008. Pestaloficiols A–E, bioactive cyclopropane derivatives from the plant endophytic fungus Pestalotiopsis fici. Bioorg. Med. Chem. 16(11): 6021–6026.
24. Ding, G.; Liu, S.; Guo, L.; Zhou, Y.; Che, Y.* 2008. Antifungal metabolites from the plant endophytic fungus Pestalotiopsis foedan.J. Nat. Prod. 71(4): 615–618. (One of the “Top 20 Most Cited” articles for the journal that were published from 2008–2011.03.31).
25. Zhang, Y.; Liu, S.; Che, Y.;* Liu, X. 2007. EpicoccinsA–D, epipolythiodioxopiperazines from a Cordyceps-colonizing isolate of Epicoccum nigrum. J. Nat. Prod. 70(9): 1522–1525. (Nat. Prod. Rep. “Hot off the press”; 2007. 24: 1208) (核心骨架被Stephan Brāse组合成;Org. Lett. 2009. 11(20): 4740.)
专利申请(第一申请人)
1. 一类具有毒杀松材线虫活性的化合物及其应用;申请号:200810055785.7;公开号:CN101481712。
2. 一种抑制烟曲霉活性的化合物制备方法及其应用;申请号:200810106546.X;公开号:CN101280326A。
3. 一种抑制烟曲霉活性的新化合物及其制备方法和应用;申请号:200810113242.6;公开号:CN 101372454A,授权号:ZL 2008 1 0113242.6 (2010年12月29日)。
4. 植物病原真菌串珠镰刀菌天然拮抗剂的发现;申请号:200910076957.3。
5. 胶枝霉素C的制备方法及其应用;申请号:200910077302.8; 公开号:CN 101805699A。
6. 一株拟盘多毛孢属内生真菌及所产生的抗肿瘤活性化合物的发现及应用;申请号:2009100777279.7; 公开号:CN 101538537A;授权号:ZL 2009 1 0077727.9 (2011年2月9日)。
7. 一种制备粉拟青霉素的方法及其专用菌株;申请号:2010105063.1; 公开号:CN101864367A。