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研究员

杨运桂 ( Yungui Yang )

职    称:
研究员
职    务:
博士生导师
E-Mail:
ygyang@big.ac.cn
研究方向:

重大疾病基因组结构和稳定性机制

 
 
 简    历:
 

   杨运桂,男,1971年生,现任中国科学院北京基因组研究所研究员,博士生导师。1995年获得复旦大学生命科学院微生物学专业理学学士;2000年获得中国科学院上海生物工程研究中心生物化学与分子生物学专业理学博士,导师-杨胜利院士和龚毅研究员;2000年-2003年世界卫生组织国际癌症研究署(International Agency for Research on Cancer,World Health Organization)汪兆琦博士实验室从事博士后研究工作;2003年-2005年世界卫生组织国际癌症研究署Staff Scientist;2005年-2008年英国癌症研究署(Cancer Research UK London Research Institute, Clare Hall Laboratories) 皇家科学院院士Tomas Lindahl博士研究室从事博士后研究工作;2008年中国科学院北京基因组研究所“百人计划”研究员。2011年任中国科学院北京基因组研究所-奥斯陆大学基因组结构和稳定性联合实验室中方主任。

《DNA repair》(2010-2012)和《Genomics Proteomics & Bioinformatics》(2009-)编委


 主要研究领域:
 

主要研究领域:

在分子、细胞、基因组学和生物信息学及人类疾病和模式生物水平上,系统研究表观遗传(生物大分子DNA、RNA和蛋白质甲基化修饰)与DNA修复调控重大疾病发生发展的基因组结构和稳定性机制(包括肿瘤,不育症和肥胖)。

研究基于基因组稳定性途径变化的肿瘤耐药分子机理,并探索以抑制或激活特定的基因组稳定性因子为切入点的新型癌症治疗方案。

研究队伍:

副研究员:牛亚梅博士(2010中科院青年人才专项入选者),魏雷震博士

助理研究员:务勇圣博士

助理工程师:黄春敏(实验室主管)

科研秘书:宣琛(工程师)

高级访问学者:Jannie Michaela Rendtlew Danielsen 博士(2011中科院外籍优秀青年科学家入选者)

博士研究生(入学年):高敏(2007);李明明(2008);赵旭(2008);杨莹(2009);史悦(2009)

硕士研究生(入学年):周东平(2009);王文岭(2009);廖友琦(2010);平晓丽(2010);肖文(2010);金康宣(2011);王文佳(2011);李苗苗(2011);郝亚鹃(2011);吕英(2012)

中科院外籍特聘研究员:英国皇家科学院院士Tomas Lindahl教授(2010入选),挪威奥斯陆大学Arne Klungland教授(2011入选),丹麦南丹麦大学Finn Kirpekar副教授(2011入选)。

联合实验室:中国科学院北京基因组研究所-奥斯陆大学基因组结构和稳定性联合实验室

国际合作研究实验室:美国芝加哥大学化学院何川教授、挪威奥斯陆大学Arne Klungland教授、德国耶拿大学汪兆琦教授、英国癌症研究所伦敦研究所Tomas Lindahl教授、丹麦哥本哈根大学Niels Mailand教授、加拿大纽芬兰纪念大学孙光教授、丹麦南丹麦大学Finn Kirpekar副教授

国内合作研究实验室:佟伟民教授(中国医学科学院基础医学研究所),许兴智教授(首都师范大学)、许顺教授(中国医科大学附属第一医院)、徐梓辉副教授(第三军医大学新桥医院)、杨福全研究员(中科院生物物理研究所)、竺晓凡教授(天津血液病医院)、王秀霞副教授(盛京医院辅助生殖中心)

往届毕业生:

硕士研究生黄春敏(2008): 中国科学院北京基因组研究所基因组结构和稳定性实验室优秀毕业生,现为北京基因组研究所杨运桂研究组助理工程师兼实验室主管

硕士研究生徐倩(2008): 中国科学院北京基因组研究所优秀毕业生,现为北京基因组研究所孙英丽研究组助理工程师


 代表论著:
 

1.  Jia G.*, Fu Y.*, Zhao X.*, Dai Q., Zheng G., Yang Y., Yi C., Lindahl T., Pan T., Yang Y.G. & He C. N6-Methyladenosine in Nuclear RNA is the Main Substrate of the Obesity-Associated FTO Protein. Nature Chemical Biology(DOI:10.1038/NChemBio.687;*,equal contribution; 2011).

2.  Wang H., Zhao A., Chen L., Zhong X., Liao J., Gao M., Cai M., Lee D.H, Li J., Chowdhury D., Yang Y.G., Pfeifer G.P., Yen Y., and Xu X. Human RIF1 encodes an anti-apoptotic factor required for DNA repair. Carcinogenesis 30:1314-1319(2009).

3.  Lindahl T., Barnes D., Yang Y.G., Robins P. Biochemical properties of mammalian TREX1 and its association with DNA replication and inherited inflammatory disease. Biochemcial Society Transactions 37(Pt 3):535-538(2009).

4.  Yang Y.G., Lindahl T., Barnes D.E. Trex1 exonuclease degrades ssDNA to prevent chronic checkpoint activation and autoimmune disease. Cell 131: 873-886 (2007). [Highlighted by Coscoy L. and Raulet D.H. DNA mismanagement leads to immune system oversight. Cell 131: 836-838 (2007)].

5.  Tong W.M., Yang Y.G., Cao W.H., Galendo D., Frappart L., Shen Y., Wang Z.Q. Poly(ADP-ribose) polymerase-1 plays a role in suppressing mammary tumourigenesis in mice. Oncogene 26: 3857-3867 (2007). [Highlighted by Alderton G. in “Tumourigenesis: Jagged little pill?”. Nature Rev. Cancer 7: 76 (2007)]

6.  Messaoudi L., Yang Y.G., Kinomura A., Yan G., Stavreva D.A., Arakawa H., Buerstedde J.M., Hainaut P., Takata M., Van Dyck E. Stress-induced subcellular redistribution of human RDM1 proteins and novel role for RDM1 in the cell response to heat shock in vertebrates. Nucleic Acids Res. 35: 6571-6587 (2007).

7.  Yang Y.G., Saidi A., Frappart P.O., Min W., Barrucand C., Dumon-Jones V., Michelon J., Herceg Z., Wang Z.Q. Conditional deletion of Nbs1 in murine cells reveals its role in branching repair pathways of DNA double-strand breaks. EMBO J. 25: 5527-5538 (2006).

8.  Yang Y.G., Frappart P.O., Frappart L., Wang Z.Q., Tong W.M. A novel function of DNA repair molecule Nbs1 in terminal differentiation of the lens fibre cells and cataractogenesis. DNA repair 5: 885-893 (2006).

9.  Murr R., Loizou J.I., Yang Y.G., Cuenin C., Li H., Wang Z.Q., Herceg Z. Histone acetylation by Trrap/Tip60 HAT modulates loading of repair proteins to DNA breaks and repair of DNA double strand breaks. Nature Cell Biol. 8: 91-99 (2006).

10. Yang Y.G., Herceg Z., Nakanishi K., Demuth I., Piccoli C., Michelon J., Hildebrand G., Jasin M., Digweed M., Wang Z.Q. The Fanconi anemia group A protein modulates homologous repair of DNA double-strand breaks in mammalian cells. Carcinogenesis 26: 1731-1740 (2005).

11. Nakanishi K., Yang Y.G., Pierce A.J., Taniguchi T., Digweed M., D'Andrea A.D., Wang Z.Q., Jasin M. Human Fanconi anemia monoubiquitination pathway promotes homologous DNA repair. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102: 1110-1115 (2005).

12. Hamimes S., Arakawa H., Stasiak A.Z., Kierzek A.M., Hirano S., Yang Y.G., Takada M., Stasiak A., Buerstedde J.M., Van Dyck E. RDM1, a Novel RNA-Recognition Motif (RRM)-Containing Protein Involved in the Cell Response to Cisplatin in Vertebrates. J. Biol. Chem. 280: 9225-9235 (2005).

13.Yang Y.G., Cortes U., Patnaik S., Jasin M., Wang Z.Q. Ablation of PARP-1 does not interfere with the repair of DNA double-strand breaks, but compromises the reactivation of stalled replication forks. Oncogene 23: 3872-3882 (2004).

Updated on Oct 21, 2011