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研究员

胡松年 ( Songnian Hu )

职    称:
 研究员
职    务:
 所长助理,博士生导师
E-Mail:
 husn@big.ac.cn
研究方向:

 主要从事基因组学、分子生物学及分子遗传学方面的研究。
 
 
 简    历：
 

　　胡松年，男，中科院北京基因组研究所研究员，博士生导师，所长助理，主要从事基因组学、分子生物学及分子遗传学方面的研究。1996年于中国农业大学生物学院植物生化系获博士学位。1996?C1998 年在中国医学科学院基础医学研究所任助研。1998?C1999年在美国西雅图华盛顿大学基因组中心任访问学者。1999?C2001年任中科院遗传所人类基因组中心暨北京华大基因研究中心总工程师。2002-2003年任杭州华大基因研发中心主任。2004年至今任中科院北京基因组研究所研究员。胡松年教授承担了多项国家863、973、国家自然科学基金等项目研究。参与了“人类基因组1%计划”、“家猪基因组计划”研究工作。并作为主要负责人之一承担了“水稻基因组计划”，并获“2002年度求是杰出科技成就集体奖”和“2003年度中国科学院杰出科技成就集体奖”，现为国家科技部重大研究计划“以细胞为单元的人类基因转录组与蛋白质组的关联性研究”的课题负责人。胡松年教授在国内外重要学术刊物上共发表论文60余篇，发表专著《基因组数据分析手册》和《基因表达序列标签（EST）数据分析手册》2本，参与编著2本。 University, Beijing, China

　　B.S. in Food Engineering (1987-1991) Tianjin University of Commerce, Tianjin, China

　　Teaching

　　Genomic and Bioinformatics workshops (2002-Present), Hangzhou and Beijing, China

　　Genomic Research (2002-Present), Chinese Academy of Sciences

主要科研活动及成果

　　　一、 正在进行的主要项目

　　　　　　1、 常染色体显性先天性静止性夜盲症致病基因的筛查与致病机理研究（项目负责人）
　　　　　　2、 青藏高原冰川微生物基因多样性的时空变化（主要研究人员）
　　　　　　3、 动植物基因组中可变剪接形式的比较分析（项目负责人）
　　　　　　4、 极端环境下耐辐射球菌的适应机理及DNA修复和抗逆性新基因的发现(主要参加人)
　　　　　　5、 人类基因组的研究策略和应用(主要参加人)
　　　　　　6、 水稻中细胞器到细胞核以及细胞器间的DNA序列迁移及其在基因组进化，细胞器起源和进化中的研究(主要参加人)
　　　　　　7、 海洋噬菌体基因组及重要功能基因研究技术(子课题负责人)

　　　二、 已经完成的主要项目

　　　　　　1、 1%人类基因组和中国重要战略资源生物基因组计划（主要研究人员）
　　　　　　2、 1%人类基因组计划“完成图”的绘制（主要研究人员）
　　　　　　3、 大规模基因组测序技术平台的建立与优化（项目负责人）
　　　　　　4、 人类基因组的研究策略和应用（创新群体主要成员）
　　　　　　5、 超级杂交水稻（籼稻）基因组测序（项目负责人）
　　　　　　6、 水稻基因组精细图的绘制（主要研究人员）
　　　　　　 7、 动植物基因组中可变剪接形式的比较分析（项目负责人）
　　　　　　8、 家猪基因组计划（主要研究人员）

　　


 主要研究领域：
 
主要的研究方向为基因组学，功能基因组学，转录组学，以及生物信息学的相关研究。
　　1.基因组学相关研究：利用新老测序仪互补的优势广泛开展对生物学或现实具有重大意义的物种进行全基因组测序，并运用生物信息学工具对测序结果进行生物信息学分析，对物种的基因组进行拼接、组装和注释，最终得到完整的基因组序列，并进一步对其构成，组分以及序列特征进行全面分析，从而进行全面的基因组学研究。主要开展微生物基因组测序，线粒体基因组、物种精细的重测序等。
　　2.功能基因组学研究：从整体基因组水平研究基因组表达及调控的研究，基因信息的识别和鉴定，基因多样性分析与比较基因组学研究等。
　　3.转录组学相关研究：以多种手段开展转录组学研究，如传统的EST、SAGE、芯片等，以及基于新测序仪Solid的转录组学研究，表达比较等分析等。如，运用多种技术手段对杂交优势分子机理进行了广泛的研究，通过子代与父母本转录组的比较分析，鉴定出大量可能与杂交优势相关的基因，并对其表达模式进行了分析，对水稻杂种优势相关基因有了一个更全貌的认识，为进一步探索其分子机理奠定了数据基础。
　　4.生物信息学：生物信息学工具的开发与改进、构建数据库等。如在对杂交优势分子机理研究中，改进SAGE标签定位的方法、采用新的注释策略，深度挖掘数据背后的分子机理；搜集、整理了目前作物杂种优势研究中产生的大量分子数据，构建了专业的杂种优势潜在相关基因数据库（HRGD），并通过网络理论研究杂种优势的分子机理。
　　5.其他方面
　　1.)MicroRNAs及其功能的研究。
　　MicroRNA研究课题组一直致力于miRNA的研究，先后开展了阴道滴虫 (Trichomonas vaginalis) miRNA组学研究、意大利蜜蜂(Apis mellifera) miRNA研究、家蚕 (Bombyx mori) small RNA研究和赤拟谷盗 (Tribolium castaneum) miRNA研究。运用计算机预测和克隆的方法，第一次在原生动物(阴道滴虫)中发现了miRNA。在家蚕 small RNA研究和赤拟谷盗miRNA研究中，我们开发了一套适用于昆虫系统的miRNA预测系统，建立了small RNA克隆鉴定平台。家蚕small RNA研究中，结合计算预测和克隆鉴定的方法共发现了151个miRNA，其中家蚕四龄蜕皮期miRNA的表达种类和数量上均多于其他发育时期，而且部分保守的miRNA在该时期表达量变化比较剧烈。
　　2.)表观基因组学数据的深度挖掘
　　随着新一代测序技术的应用，已经产生了大量模式生物的组蛋白修饰和DNA甲基化修饰的数据，例如：人的20种组蛋白甲基化图谱的构建、人和鼠表观修饰的比较谱、鼠细胞发生系（多能干细胞/神经原细胞 /胚胎纤维原细胞）的修饰谱的动态变化和比较、拟南芥水稻的修饰谱等。而且这些数据还在不断地向广度和深度方面延伸。 如何整合和挖掘这些大量原始数据提出了迫切要求。该研究组将利用data mining 的工具建立计算模型，提出表观修饰和基因表达关系的工作假设，而后用整体生物学的手段证实与改进模型和假设。 

 代表论著：
 
  1. Ye Feng, Chih-Jung Chen, Lin-Hui Su, Songnian Hu, Jun Yu, Cheng-Hsun Chiu 2008 Evolution and pathogenesis of Staphylococcus aureus: lessons learned from genotyping and comparative genomics. FEMS Microbiology Reviews 32(1):23-37. (IF 8.691)
  2. Fan Xiaolei, Fang Yongjun, Hu Songnian, Wang Guangce 2007 Generation and analysis of 5318 expressed sequence tags (ESTs) from filamentous sporophyte of Porphyra haitanensis Ueda (Rhodophyta). Journal of Phycology 43 (6): 1287 -1294 （通讯作者）(IF 2.580)
  3. Xiangtian Zhou, Weiwei Wang, Fan Lu, Songnian Hu, Liqin Jiang, Dongsheng Yan, Xiaowei Zhang, Xiaomin Yu, Jun Yu, Jia Qu 2007 A comparative gene expression profile of the whole eye from human, mouse, and guinea pig. Molecular Vision 13:2214-2221. (IF 2.377)
  4. Jun Li, Yufeng Wang, Songnian Hu, Rulun Zhou,Xiaomin Yu, Bing Wang, Lili Guan, Li Yang, Feng Zhang, Stephen V Faraone 2007 The monoamine oxidase B gene exhibits significant association to ADHD. American Journal of Medical Genetics. Part B: Neuropsychiatric Genetics (online). （通讯作者）(IF 4.463)
  5. Chen Huan, Xu Zhenjian, Tian Bing, Chen Weiwei, Hu Songnian, Hua Yuejin 2007 Transcriptional profile in response to ionizing radiation at low dose in Deinococcus radiodurans. Progress in Natural Science 17(5):529-536. （通讯作者）(IF 0.531)
  6. Xianran Li, LuBin Tan, Haiyan Huang, Zuofeng Zhu, Chenji Li, Songnian Hu, Chuanqing Sun 2007 Construction of a bacterial artificial chromosome (BAC) library of common wild rice (Oryza rufipogon Griff.) for map-based cloning of genes selected during the domestication of rice. Biotechnology Letters (online first) (IF 1.134)
  7. Wei-Hua Chen, Guanting Lv, Congying Lv, Changqing Zeng, Songnian Hu 2007 Systematic analysis of alternative first exons in plant genomes. BMC Plant Biology 7:55. （通讯作者）（IF 3.44）
  8. ShuHui Song, HongZhu Qu, Chen Chen, Songnian Hu, Jun Yu 2007 Differential gene expression in an elite hybrid rice cultivar (Oryza sativa, L) and its parental lines based on SAGE data. BMC Plant Biology 7:49.（IF 3.44）
  9. Peng Cui, Rimutu Ji, Feng Ding, Dan Qi, Hongwei Gao, He Meng, Jun Yu, Songnian Hu, Heping Zhang 2007 A complete mitochondrial genome sequence of the wild two-humped camel (Camelus Bactrianus ferus): an evolutionary history of camelidae. BMC Genomics 8:241. （通讯作者）(IF 4.029)
  10. Jiangwei Yan, Hui Tang, Yin Liu, Wanshan Ma, Qingxia Zhang, Junwei Gao, Zhangping Jiao, Leipeng Shang, Yuting Jing, Songnian Hu, Jun Yu 2007 Allele frequencies of mitochondrial D-loop (CA)(n) repeat polymorphism in six Chinese ethnic groups. Legal Medicine 9(6):330-331.
  11. Qingyou Liu, Xuexia Wang, Jizeng Zhang, Weihua Chen, Xiaowei He, Ying Lin, Zhenqiang Wu, Yong Zhu, Songnian Hu, Xiaoning Wang 2007 Mapping Cynomolgus monkey MHC Class I district on chromosome 6p13 with pooled cDNAs. Biotechnic & Histochemistry (accepted) （通讯作者）(IF 0.553)
  12. Zhonghua Zhang, Yajun Deng, Jun Tan, Songnian Hu, Jun Yu, Qingzhong Xue 2007 A genome-wide microsatellite polymorphism database for the indica and japonica rice. DNA Research 14(1):37-45. (IF 3.066)
  13. Jan Gorodkin, Susanna Cirera, Jakob Hedegaard, Michael J. Gilchrist, Frank Panitz, Claus B. Jorgensen, Karsten Scheibye-Knudsen, Troels Arvin, Steen Lumholdt, Milena Sawera, Trine Green, Bente J. Nielsen, Jakob H. Havgaard, Carina Rosenkilde, Jun Wang, Heng Li, Ruiqiang Li, Bin Liu, Songnian Hu, Wei Dong, Wei Li, Jun Yu, Jian Wang, Hans-Henrik Staerfeldt, Rasmus Wernersson, Lone B. Madsen, Bo Thomsen, Henrik Hornshoj, Bujie Zhan, Xuegang Wang, Xuefei Wang, Lars Bolund, Soren Brunak, Huanming Yang, Christian Bendixen, Merete Fredholm 2007 Porcine transcriptome analysis based on 97 non-normalized cDNA libraries and assembly of 1,021,891 ESTs. Genome Biology 8:R45 (IF 7.172)
  14. Xiangjun Tian, Jing Zheng, Songnian Hu, Jun Yu 2007 The discriminatory transfer routes of tRNA genes among organellar and nuclear genomes in flowering plants: a genome-wide investigation on indica rice. Journal of Molecular Evolution 64(3):299-307. (IF 2.767)
  15. Donna M. Muzny,Steven E. Scherer，Rajinder Kaul，Jing Wang，Jun Yu， Ralf Sudbrak， Christian J. Buhay, Rui Chen, Andrew Cree, Yan Ding, Shannon Dugan-Rocha, Rachel Gill, Preethi Gunaratne, R. Alan Harris, Alicia C. Hawes, Judith Hernandez, Anne V. Hodgson, Jennifer Hume, Andrew Jackson, Ziad Mohid Khan, Christie Kovar-Smith, Lora R. Lewis, Ryan J. Lozado, Michael L. Metzker, Aleksandar Milosavljevic, George R. Miner, Margaret B. Morgan, Lynne V. Nazareth, Graham Scott, Erica Sodergren, Xing-Zhi Song, David Steffen, Sharon Wei, David A. Wheeler, Mathew W. Wright, Kim C. Worley1, Ye Yuan, Zhengdong Zhang, Charles Q. Adams1, M. Ali Ansari-Lari, Mulu Ayele, Mary J. Brown, Guan Chen, Zhijian Chen, James Clendenning, Kerstin P. Clerc-Blankenburg, Runsheng Chen, Zhu Chen, Clay Davis1, Oliver Delgado, Huyen H. Dinh, Wei Dong, Heather Draper, Stephen Ernst, Gang Fu,Manuel L. Gonzalez-Garay, Dawn K. Garcia, Will Gillett, Jun Gu, Bailin Hao, Eric Haugen, Paul Havlak, Xin He, Steffen Hennig, Songnian Hu, Wei Huang, Laronda R. Jackson, Leni S. Jacob, Susan H. Kelly, Michael Kube, Ruth Levy, Zhangwan Li, Bin Liu, Jing Liu, Wen Liu, Jing Lu, Manjula Maheshwari, Bao-Viet Nguyen, Geoffrey O. Okwuonu, Anthony Palmeiri, Shiran Pasternak, Lesette M. Perez1, Karen A. Phelps, Farah J. H. Plopper, Boqin Qiang, Christopher Raymond, Ruben Rodriguez, Channakhone Saenphimmachak, Jireh Santibanez, Hua Shen, Yan Shen, Sandhya Subramanian, Paul E. Tabor, Danie Verduzco, Lenee Waldron, Jian Wang, Jun Wang, Qiaoyan Wang, Gabrielle A. Williams, Gane K.-S. Wong, Zhijian Yao, JingKun Zhang, Xiuqing Zhang, Guoping Zhao, Jianling Zhou, Yang Zhou, David Nelson, Hans Lehrach, Richard Reinhardt, Susan L. Naylor, Huanming Yang, Maynard Olson, George Weinstock, Richard A. Gibbs. 2006 The DNA sequence, annotation and analysis of human chromosome 3. Nature 440:1194-1198. (IF 26.681)
  16. Bing Zhang, Qinghua Liu, Wei Yin, Xiaowei Zhang, Yijun Huang, Yingfeng Luo, Pengxin Qiu, Xinwen Su, Jun Yu, Songnian Hu, Guangmei Yan 2006 Transcriptome analysis of Deinagkistrodon acutus venomous gland focusing on cellular structure and functional aspects using expressed sequence tags. BMC Genomics 7:152. (IF 4.029)
  17. Jiangwei Yan, Yacheng Liu, Hui Tang, Qingxia Zhang, Zhenyi Huo, Songnian Hu, Jun Yu 2006 Mutations at 17 STR loci in Chinese population. Forensic Science International 162(1-3):53-54. (IF 1.397)
  18. Xiangjun Tian, Jing Zheng, Songnian Hu, Jun Y 2006 The rice mitochondrial genomes and their variations. Plant Physiology 140(2):401-410. (IF 6.125)
  19. Wei-Hua Chen, Xue-Xia Wang, Wei Lin, Xiao-Wei He, Zhen-Qiang Wu, Ying Lin, Song-Nian Hu, Xiao-Ning Wang 2006 Analysis of 10,000 ESTs from lymphocytes of the cynomolgus monkey to improve our understanding of its immune system. BMC Genomics 7:82. （通讯作者）(IF 4.029)
  20. Qingnhua Liu, Xiaowei Zhang, Wei Yin, Chenji Li, Yijun Huang, Xingwen Su, Pengxin Qiu, Songnian Hu, Guangmei Yan 2006 A catalog for transcripts in the venom gland of the Agkistrodon acutus: Identification of the toxins potentially involved in coagulopathy. Biochemical and Biophysical Research Communications 341(2):522-531. (IF 2.855)
  21. Zhao Hui, Li Qizhai, Li Jun, Zeng Changqing, Hu Songnian, Yu Jun 2006 The study of neighboring nucleotide composition and transition/transversion bias. Science in China: Series C Life Sciences 49(4):395-402. (IF 0.533)
  22. Su Zhixi, Dong Xinjiao, Zhang Bing, Zeng Yanwu, Fu Yan, Yu Jun, Hu Songnian 2006 Gene expression profiling in porcine mammary gland during lactation and identification of breed- and developmental-stage-specific genes. Science in China: Series C Life Sciences 49(1):26-36. （通讯作者）(IF 0.533)
  23. Hong Yu, Jianbin Wang, Jiehua Ye, Petrus Tang, Chishih Chu, Songnian Hu, Cheng-Hsun Chiu 2006 Complete nucleotide sequence of pSCV50, the virulence plasmid of Salmonella enterica serovar Coleraesuis SC-B67. Plasmid 55:145-151. (IF 1.956)
  24. Jianbin Wang, Yan Jiang, Myriam Vincent, Yongqiao Sun, Hong Yu, Jing Wang, Qiyu Bao, Huimin Kong, Songnian Hu 2005 Complete genome sequence of bacteriophage T5. Virology 332:45-65. （通讯作者）(IF 3.525)
  25. Rasmus Wernersson, Mikkel H Schierup, Frank G Jørgensen, Jan Gorodkin, Frank Panitz, Hans-Henrik Stærfeldt, Ole F Christensen, Thomas Mailund, Henrik Hornshøj, Ami Klein, Jun Wang, Bin Liu, Songnian Hu, Wei Dong, Wei Li, Gane KS Wong, Jun Yu, Jian Wang, Christian Bendixen, Merete Fredholm, Søren Brunak, Huanming Yang, Lars Bolund 2005 Pigs in sequence space: A 0.66X coverage pig genome survey based on shotgun sequencing. BMC Genomics 6:70 (IF 4.029)
  26. Jiabin Tang, Hongai Xia, Dayong Li, Mengliang Cao, Yong Tao, Wei Tong, Xiuqing Zhang, Songnian Hu, Jian Wang, Jun Yu, Huanming Yang, Lihuang Zhu 2005 Gene expression profiling in rice young panicle and vegetative organs and identification of panicle-specific genes through known gene functions. Molecular Genetics and Genomics 274(5):467-476. (IF 2.552)
  27. Jun Yu, Jun Wang, Wei Lin, Songgang Li, Heng Li, Jun Zhou, Peixiang Ni, Wei Dong, Songnian Hu, etc. 2005 The genomes of Oryza sativa: a history of duplications. PLOS Biology 3(2):0266-0281. (IF 14.101)
  28. Cheng-Hsun Chiu, Petrus Tang, Chishih Chu, Songnian Hu,Qiyu Bao, Jun Yu, Yun-Ying Chou, Hsin-Shih Wang, Ying-Shiung Lee 2005 The genome sequence of Salmonella enterica serovar Choleraesuis, a highly invasive and resistant zoonotic pathogen. Nucleic Acids Research 33(5):1690-1698. (IF 6.317)
  29. Xiaoling Liu, Shulin Zhuang, Songnian Hu, Feng Zhang, Bing Lin, Xu Li, Donbin Xu, Shi-Han Chen 2005 A dominant form of congenital stationary night blindness (adCSNB) in a large Chinese family. Annals of Human Genetics 69(3):315-321.(IF 2.727)
  30. Jiang Fanbo, Chen Chen, Deng Yajun, Yu Jun, Hu Songnian 2005 Analysis of porcine MHC expression profile. Chinese Science Bulletin 50(9):880-890.（通讯作者） (IF 0.722)
  31. The Chinese human genome sequencing consortium (one of the first authors) 2005 “Beijing Region”(3pter-D3S3397) of the human genome: complete sequence and analysis. Science in China Ser. C Life Sciences 48(4):311-329. (IF 0.533)
  32. Luo Chunqing, Li Yan, Zhang Xiaowei, Zhang Yilin, Zhang Haiqing, Chen Chong, Xu Zuyuan, Cui Peing, Hu Songnian, Yang Huanming, Dong Wei 2005 DNA sequence comparative analysis of the 3pter-p26 region of human genome. Science in China Ser. C Life Sciences 48(1):34-40. (IF 0.533)
  33. Zhong Boxiong, Yu Yingpu, Xu Yusong, Yu Hong, Lu Xingmeng, Miao Yungen, Yang Jun, Xu Hao, Hu Songnian, Lou Chengfu 2005 Analysis of ESTs and gene expression patterns of the posterior silkgland in the fifth instar larvae of silkworm, Bombyx mori L. Science in China Ser. C Life Sciences 48(1):25-33. (IF 0.533)
  34. International Chicken Polymorphism Map Consortium. Polymorphism discovery and analysis: Beijing Institute of Genomics of Chinese Academy of Sciences and James D. Watson Institute of Genome Sciences of Zhejiang University. Gane Ka-Shu Wong, Bin Liu, Jun Wang, Yong Zhang, Xu Yang, Zengjin Zhang, Qingshun Meng,Jun Zhou, Dawei Li, Jingjing Zhang, Peixiang Ni, Songgang Li1, Longhua Ran, Heng Li1, Jianguo Zhang, Ruiqiang Li, Shengting Li, Hongkun Zheng,Wei Lin, Guangyuan Li, Xiaoling Wang, Wenming Zhao, Jun Li, Chen Ye, Mingtao Dai, Jue Ruan, Yan Zhou, Yuanzhe Li, Ximiao He, Yunze Zhang,Jing Wang, Xiangang Huang, Wei Tong, Jie Chen, Jia Ye1, Chen Chen, Ning Wei, Guoqing Li, Le Dong, Fengdi Lan, Yongqiao Sun,Zhenpeng Zhang, Zheng Yang, Yingpu Yu, Yanqing Huang, Dandan He, Yan Xi, Dong Wei, Qiuhui Qi, Wenjie Li, Jianping Shi, Miaoheng Wang,Fei Xie, Jianjun Wang, Xiaowei Zhang, Pei Wang, Yiqiang Zhao, Ning Li, Ning Yang, Wei Dong, Songnian Hu, Changqing Zeng, Weimou Zheng, Bailin Hao. 2004 A genetic variation map for chicken with 2.8 million single nucleotide polymorphisms. Nature 432:717-722. (IF 26.681)
  35. Songlin Chen, Meiyu Xu, Songnian Hu, Lin Li 2004 Analysis of immune-relevant genes expressed in red sea bream (Chrysophrys major) spleen. Aquaculture 240: 115-130. (IF 2.081)
  36. Jiabin Tang, Hongai Xia, Mengliang Cao, Xiuqing Zhang, Wangyong Zeng, Songnian Hu, etc. 2004 A comparison of rice chloroplast genomes. Plant Physiology 135:412-420. (IF 6.125)
  37. Xingchao Shentu, Ke Yao, Wen Xu, Shu Zheng, Songnian Hu, Xiaohua Gong 2007 Special fasciculiform cataract caused by a mutation in the γD-crystallin gene. Molecular vision 10:233-239 (IF 2.377)
  38. Bing Zhang, Wu Jin, Yanwu Zeng, Zhixi Su, Songnian Hu, Jun Yu 2004 EST-based analysis of gene expression in the porcine brain. Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2(4):237-244. （通讯作者）
  39. Li Lanjuan, Wang Zhigang, Lu Yiyu, Bao Qiyu, Chen Suhong, Wu Nanping, Cheng Suyun, Weng Jingqing, Zhang Yanjun, Yan Juying, Mei Lingling, Wang Xiaomeng, Zhu Hanping, Yu Yingpu, Zhang Minli, Li Minhong, Yao Jun, Lu Qunying, Yao Pingping, Bo Xiaochen, Wo Jianer, Wang Shengqi & Hu Songnian 2003 Severe acute respiratory syndrome-associated coronavirus genotype and its characterization. Chinese Medical Journal 116(9):1288-1292. (IF 0.615)
  40. Yanjiong Chen, Shengbin Li, Lin Ye, Jianing Geng, Yajun Deng, Songnian Hu 2003 Gene expression profiling in porcine fetal thymus. Genomics, Proteomics & Bioinformatics 1(2):171-172.
  41. Yan Zhou, Jiabin Tang, Michael G. Walker, Xiuqing Zhang, Jun Wang, Songnian Hu, etc. 2003 Gene identification and expression analysis of 86,136 expressed sequence tags (EST) from the rice genome. Genomics, Proteomics & Bioinformatics 1(1):26-42.
  42. Jun Yu*, Songnian Hu*, Jun Wang*, Gane Ka-Shu Wong*, etc. 2002 A draft sequence of the rice genome (Oryza sativa L. subsp. indica). Science 296: 79-92. (*these authors contributed equally to this work.)（并列第一作者）(IF 30.028)
  43. Qiyu Bao, Yuqing Tian, Wei Li, Zuyuan Xu, Zhenyu Xuan, Songnian Hu, etc. 2002 A complete sequence of the T. tengcongensis genome. Genome Research 12:689-700. (IF 10.256)
  44. Zhang Xiuqing, Yang Huanming, Yu Jun, Chen Cong, Zhang Guangyu, Bao Jingyue, Du Yutao, Kibukawa M, Li Zhijie, Wang Jun, Hu Songnian, Dong Wei, Wang Jian 2002 Genomic organization, transcript variant and comparative analysis of the human nucleoporin 155 (Nup 155) gene. Gene 288:9-18. (IF 2.721)
  45. Wu Qingfa, Dong Wei, Qi Xiaohua, Bao Weidong, Niu Yuxin, Zhang Yiling, Zhang Haiqing, Chen Chong, Liu Bin, Hu Songnian, Wang Jian, Yang Huanming 2002 Genomic structure of metabotropic glutamate receptor 7 and comparison of genomic structures of extracellular domains of mGluR family. Chinese Science Bulletin 47(16):1330-1336. (IF 0.722)
  46. Zhou Yan, Hu Songnian, Huang Xiaowei, Zhou Haijun, Tan Xinyu, Peng Xiaozhong, Qiang Boqin, Yuan Jiangang 2002 Construction of human and mouse brain cDNA libraries and isolation of full-length cDNAs. Progress in Natural Science 12(6):477-480. (IF 0.531)
  47. International Human Genome Sequencing Consortium 2001 Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature 409:860-922. (IF 26.681)
  48. Yi Pang, Jianxiu Yu, Lihua Wang, Xiaohui Hu, Weidong Bao, Gang Li, Chong Chen, Hua Han,. Songnian Hu & Huanming Yang 2001 Sequence analysis of the spodoptera litura multicapsid nucleopolyhedrovirus genome. Virology 287:391-404. (IF 3.525)
  49. Jun Yu*, Songnian Hu*, Jun Wang*, etc. 2001 A draft sequence of the rice (Oryza sativa L. subsp. indica) genome. Chinese Science Bulletin 46(23): 1937-1942. (*these authors contributed equally to this work.)　（并列第一作者）(IF 0.722)
  50. Jin Hulin, Hu Songnian, Li Guangtao, Tu Chun, Yuan Jianggang and Qiang Boqin 2000 Isolation and identification of cDNA fragments and full-length cDNA differentially expressed in human glioblastoma cell line BT-325 versus all-trans retinoic acid induction. Chinese Medical Sciences Journal 15(4):195-200.
  51. Li Guangtao, Jin Hulin, Hu Songnian, Jin Jian, Tu Chun, Yuan Jiangang and Qiang Boqin 2000 Cloning and identification of a novel human glioma differentiation related gene GDR1. Chinese Science Bulletin 45(11):995-999. (IF 0.722)
  52. Bai Longchuan, Yuan Jiangang, Hu Songnian, Zhao Quanbi, Shao Yiming, Qiang Boqin 1998 Inhibition of human immunodeficiency virus type I replication by transdominant mutant Tat proteins. Progress in Natural Science 8(6):695-699. (IF 0.531)
  53. 杨光，邓亚军，胡松年，吴东颖，李生斌，王振原，朱波峰，朱军，刘耀 2006 中国华北地区汉族人群HLA两基因座的PCR-SBT分型。中国法医学杂志 21(3):166-168.
  54. 杨光，邓亚军，阎春霞，吴东颖，胡松年，朱波峰，李生斌，张秀清，刘耀 2006 中国健康人群人类白细胞抗原B27亚型频率分布。中国医学科学院学报 28(2):240-243.
  55. 刘清华，胡松年，银巍，苏兴文，张晓伟，李晨吉，邱鹏新，颜光美 2006 尖吻蝮毒腺cDNA文库的构建、金属蛋白酶基因克隆和序列分析。中国药理学与毒理学杂志 20(2):81-90.
  56. 庞国兴，王广策，胡松年，曾呈奎 2005 坛紫菜(Porphyra haitanensis)丝状孢子体EST的获取及其生物信息学分析。海洋与湖沼 36(5):452-458. (通讯作者)
  57. 邓亚军，杨光，吴东颖，胡松年，李生斌，朱军，朱波峰，刘耀 2006 北京地区人群HLA-A、B、DRB1的聚合酶链反应－直接测序分型研究。中华医学遗传学杂志 23(1):103-106.
  58. 邓亚军，杨光，吴东颖，胡松年，李生斌，朱波峰，朱军，刘耀 2005 PCR-SBT法检测北京地区人群HLA-DRB1遗传多态性。法医学杂志 21(4):280-285.
  59. 庄树林，邹建卫，彭春龙，刘晓玲，陈士翰，黄方亮，胡松年，俞庆森 2005 中国一先天性静止性夜盲家系5个已知突变位点的排除。浙江大学学报(医学报) 34(3):255-259.
  60. 谢雁鸣，胡松年，韩华，寇秋爱，高蕊，杜宝俊 2005 北京、武汉、福建原发性骨质疏松症VDR I、VDRII-1、VDR II-2基因单核苷酸多态性研究。中国骨质疏松杂志 11(1):54-57.
  61. 谢雁鸣，韩华，胡松年，寇秋爱，高蕊，杜宝俊 2004 原发性骨质疏松症除钙素受体和雌激素受体的基因单核苷酸多态性研究。中国老年学杂志 24(12):1135-1136.
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