肖景发----中国科学院北京基因组研究所

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副研究员

肖景发 ( Jingfa Xiao )
职称:	副研究员
职务:	硕士生导师
E-Mail:	xiaojingfa@big.ac.cn
研究方向:	生物信息学

简历：

　　肖景发博士1998年起在吉林大学攻读博士学位, 主要进行大气中重要化学反应的机理研究，在Journal of Physical Chemistry, Journal of Computational Chemistry和Phys. Chem. Chem. Phys等专业杂志发表论文十余篇。2003年起在协和医科大学药物所从事糖尿病相关靶点的计算机辅助药物分子设计研究, 其中关于蛋白质酪氨酸磷酸酯酶药物分子设计已经申请到自然科学基金的资助(抗糖尿病的新型PTP 1B抑制剂的设计、合成及构效分析), 先后在Journal of Molecular Graphics and Modelling、Protein Engineering和Bioorganic & Medicinal Chemistry等专业杂志发表相关论文数篇。2005年起在犹他大学化学系从事计算分子生物学的研究，主要的研究课题是同源模建和分子对接算法发展和应用, 并参加NCF-Information Technology Research项目Computational Science and Engineering Online研究。其中发展的软件CSE－Online已经得到计算科学领域的工作者广泛应用。2007起到中国科学院北京基因组研究所, 主要从事生物信息学和计算生物学等方面的研究。

　　91年考入四川大学生物系生物学专业，

　　98年考入吉林大学理论化学国家重点实验室攻读博士，

　　于2003年7月获得理学博士学位。

　　于2003年－2005年在协和医科大学药物所进行博士后研究。

　　于 2005年－2007年在美国犹他大学化学系进行博士后研究工作。

　　2007年到中国科学院北京基因组研究所工作。

　　

主要研究领域：

目前的研究工作主要有以下四方面：

（1）重要动植物和微生物的比较基因组学和转录组学研究；

（2）小蛋白的结构功能、进化以及调控机制等相关的生物信息学研究；

（3）密码子进化研究；

（4）利用同源模拟，分子对接, 虚拟筛选, 以及定量构效关系等方法实现计算机辅助药物分子设计；研究药物与靶标蛋白之间、蛋白与蛋白之间的相互作用机理。

代表论著：

1.Jingfa Xiao, Jun Yu. An organization and evolution of the genetic code, Sci China Ser C-life Sci. 2009, 39, 717 - 726

2.Fengyu Wang, Jingfa Xiao*, Linlin Pan, Ming Yang, Guoqian Zhang, Yun Yu. A Systemic Study of Mini-proteins in Bacterial and Archaea. PLOS one. 2008, 3, e4027.

3.Jingfa Xiao，Jun Yu. A Scenario on the Stepwise Evolution of the Genetic Code. Genomics, Proteomics & Bioinformatics. 5, 143-151, (2007).

4.Jingfa Xiao, Thanh N. Truong. A theoretical study to investigate HHR3/HHR4 selectivity: Receptor modeling and molecular docking of histaminergic ligand. Abstr. Pap. Am. Chem. Soc. 2006, 232, 293-COMP.

5.Jingfa Xiao, ZongruGuo, YanShen Guo, et al, Computational Study of Human Phosphomannose Isomerase: Insights from Homology Modeling and Molecular Dynamics Simulation of Enzyme Bound Substrate. J. Mol. Graph. Model.25, 289, (2006).

6. Jingfa Xiao, ZongruGuo, Yanshen Guo, et al, Inhibitory mode of pyrazolo[1,5-b]pyridazin series derivatives against GSK-3: molecular docking and 3D-QSAR analyses. Protein. Eng. Des. Sel. 19, 47, (2006).

7.Jing-Fa Xiao, Ze-Sheng Li, Miao Sun, et al, Homology modeling and molecular dynamics study of GSK3/SHAGGY-like kinase. Comp. Bio. Chem. 3, 179, (2004).

8.Jing-Fa Xiao, Ze-Sheng Li, Chia-Chung Sun. Homology modeling and molecular dynamics studies of a novel C3-like ADP-ribosyltransferase. Bioorganic. Med. Chem. 12, 2035, (2004).